« En novembre 2025, l’organisation ELIXIR publiait un rapport soulignant la contribution des logiciels et des workflows open source à l’innovation dans le domaine des sciences de la vie. Ce rapport comprend notamment une analyse qualitative basée sur quinze entretiens avec des représentants d’entreprises de bioinformatique.…
![Knafou, Julien David Marc. «TransBERT: Leveraging Automatic Translation for Domain-Specific Knowledge Transfer » [thèse]](https://i0.wp.com/lalist.inist.fr/wp-content/uploads/2021/03/cnrs_19930001_0279_MD.jpg?fit=1200%2C750&ssl=1)
« Cette thèse vise à surmonter la barrière linguistique en sciences de la vie grâce à TransBERT, un modèle de langue biomédicale entraîné exclusivement sur plus de 22 millions de résumés (abstracts) PubMed/MEDLINE traduits automatiquement en français. Les résultats montrent que TransBERT atteint des performances comparables, voire supérieures, aux modèles de…
« Strengthening the resilience and independence of the life sciences research infrastructure in Europe is necessary regarding the risks posed by dependencies on US-based information services. ZB MED – Information Centre for Life Sciences will therefore develop an open, reliable and sustainable alternative to the PubMed database. This alternative database will…
« The main goals and challenges for the life science communities in the Open Science framework are to increase reuse and sustainability of data resources, software tools, and workflows, especially in large-scale data-driven research and computational analyses. Here, we present key findings, procedures, effective measures and recommendations for generating and establishing…
« Nowadays, the FAIR Principles guide data policy actions and professional practices in the public and private sectors. However, despite such global endorsements, the FAIR Principles are aspirational, remaining elusive at best, and intimidating at worst. To address the lack of practical guidance, and help with capability gaps, we developed the…
« Modern life sciences studies depend on the collection, management and analysis of comprehensive datasets in what has become data-intensive research. Life science research is also characterised by having relatively small groups of researchers. (…) Parallel to this, there has been an urgent call by initiatives like FAIR and Open Science…
« An independent study by management consultancy Charles Beagrie Ltd. has found that the data resources managed by EMBL’s European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) offer exceptional value for money. The report estimated that the return on investment in research and development depending on EMBL-EBI managed data is worth £1.3…
« (…) This report demonstrates that access to open, free resources, such as data and software, is the underlying basis for breakthrough discoveries, scientific excellence and entrepreneurial endeavours.
Studying three different European innovation ecosystems – Cambridge, Berlin and Barcelona –, the report explores the factors and actors that contribute to…
« DeepMind a annoncé aujourd’hui son partenariat avec le Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL), le laboratoire de référence pour les sciences de la vie en Europe, afin de mettre à disposition de manière libre et gratuite à l’ensemble de la communauté scientifique la base de données la plus complète et…
« Le marché de l’édition scientifique a connu de nombreuses évolutions avec l’avènement du numérique, du Libre Accès et des nouveaux modèles de publication. Cet article aborde le cas de l’éditeur commercial JoVE (Journal of Visualized Experiments) à l’origine d’un nouveau modèle de publication d’articles scientifiques en Sciences de la Vie,…
