« Executable papers take transparency and openness in research communication one step further. In this comment, an early career researcher reports her experience of creating an executable paper as a journey through Open Science. (…)
As researchers, we aim at having a direct and positive impact on our society through…
« New open-source technology lets eLife authors publish Executable Research Articles that treat live code and data as first-class citizens.
Since 2017, we have been working on the concept of computationally reproducible papers. The open-source suite of tools that started life as the Reproducible Document Stack…
« Recent reproducibility case studies have raised concerns showing that much of the deposited research has not been reproducible. One of their conclusions was that the way data repositories store research data and code cannot fully facilitate reproducibility due to the absence of a runtime environment needed for the code execution.…
« La plupart des recherches scientifiques sont fausses. Telle est la conclusion provocatrice d’un article célèbre de PLOS initialement publié en 2005 : « Nos simulations montrent que dans la plupart des cadres expérimentaux il est moins probable qu’une conclusion scientifique soit vraie que fausse ». (Ioannidis 2005).Depuis, ce constat préoccupant…
« (…) This paper provides practical, actionable advice on how to actually share data alongside research. The key message is sharing data falls on a continuum, and entering it should come with minimal barriers. (…) »
« What information might you need to be able to make sense of your research in 6 months… 3 years…10 years? What might another researcher need to know to reproduce your findings? (…) »
« Software has become an indissociable support of technical and scientific knowledge. The preservation of this universal body of knowledge is as essential as preserving research articles and data sets. In the quest to make scientific results reproducible, and pass knowledge to future generations, we must preserve these three main pillars:…
« En très peu de mots, Org mode pourrait être présenté comme le cousin germain des Jupyter notebooks. Org mode et les notebooks créés via Jupyter lab représentent 2 solutions particulièrement intéressantes et matures dans un contexte de recherche. Les interfaces interactives créées via Org mode et…
« Seriez-vous capable de faire fonctionner aujourd’hui le code que vous avez créé pour des recherches menées il y a dix ans et plus ? C’est le défi que lance le concours Ten Years Reproductibility Challenge, une initiative de la revue ReScience C. Entretien avec son éditeur…
« Le logiciel est un objet hybride au sein de la recherche, dont il est à la fois moteur (comme outil), résultat (comme preuve d’existence d’une solution) et objet d’études (comme artefact).
Ce statut spécifique doit amener à la définition de stratégies, d’outils et de procédures adaptés aux différents enjeux…
