« Recent reproducibility case studies have raised concerns showing that much of the deposited research has not been reproducible. One of … Continuer la lecture de « Advancing computational reproducibility in the Dataverse data repository platform »
EPRIST – La recherche en crise de reproductibilité ? (.pdf)
« La plupart des recherches scientifiques sont fausses. Telle est la conclusion provocatrice d’un article célèbre de PLOS initialement publié en … Continuer la lecture de « EPRIST – La recherche en crise de reproductibilité ? (.pdf) »
A Realistic Guide to Making Data Available Alongside Code to Improve Reproducibility
« (…) This paper provides practical, actionable advice on how to actually share data alongside research. The key message is sharing … Continuer la lecture de « A Realistic Guide to Making Data Available Alongside Code to Improve Reproducibility »
Source > arxiv.org, Nicholas J Tierney, Karthik Ram, 6 février 2020, arXiv:2002.11626v1
Lego: Metadata for reproducibility
« What information might you need to be able to make sense of your research in 6 months… 3 years…10 years? … Continuer la lecture de « Lego: Metadata for reproducibility »
Curated Archiving of Research Software Artifacts : lessons learned from the French open archive (HAL)
« Software has become an indissociable support of technical and scientific knowledge. The preservation of this universal body of knowledge is … Continuer la lecture de « Curated Archiving of Research Software Artifacts : lessons learned from the French open archive (HAL) »
Org mode, un compagnon de route pour les adeptes de data science et de recherche reproductible
« En très peu de mots, Org mode pourrait être présenté comme le cousin germain des Jupyter notebooks. Org mode et … Continuer la lecture de « Org mode, un compagnon de route pour les adeptes de data science et de recherche reproductible »
« 10 Years Reproductibility Challenge » : pour l’amour du code pérenne
« Seriez-vous capable de faire fonctionner aujourd’hui le code que vous avez créé pour des recherches menées il y a dix … Continuer la lecture de « « 10 Years Reproductibility Challenge » : pour l’amour du code pérenne »
Source > grandlabo.com, 21 janvier 2020
Note d’opportunité sur la valorisation des logiciels issus de la recherche. Groupe Projet « Logiciels libres et open source » Comité pour la Science Ouverte
« Le logiciel est un objet hybride au sein de la recherche, dont il est à la fois moteur (comme outil), … Continuer la lecture de « Note d’opportunité sur la valorisation des logiciels issus de la recherche. Groupe Projet « Logiciels libres et open source » Comité pour la Science Ouverte »
Hackathon Software Heritage : référencer, préserver et valoriser le code source des logiciels scientifiques (mardi 31 mars 2020, INRIA – Talence)
« Objectifs Archiver et référencer du code source en vue d’une recherche plus reproductible Partager et valoriser du code source en … Continuer la lecture de « Hackathon Software Heritage : référencer, préserver et valoriser le code source des logiciels scientifiques (mardi 31 mars 2020, INRIA – Talence) »
CODECHECK: An open-science initiative to facilitate sharing of computer programs and results presented in scientific publications
« (…) We are building a computational platform, called CODECHECK (http://www.codecheck.org.uk), to enhance the availability, discovery and reproducibility of published computational … Continuer la lecture de « CODECHECK: An open-science initiative to facilitate sharing of computer programs and results presented in scientific publications »
Seven Easy Steps to Open Science – An Annotated Reading List
« (…) This paper provides an introduction to open science and related reforms in the form of an annotated reading list … Continuer la lecture de « Seven Easy Steps to Open Science – An Annotated Reading List »
Publishers’ Responsibilities in Promoting Data Quality and Reproducibility
« Scholarly publishers can help to increase data quality and reproducible research by promoting transparency and openness. Increasing transparency can be … Continuer la lecture de « Publishers’ Responsibilities in Promoting Data Quality and Reproducibility »
Source > link.springer.com, Iain Hrynaszkiewicz, 7 novembre 2019
Uses and Reuses of Scientific Data: The Data Creators’ Advantage
« Open access to data, as a core principle of open science, is predicated on assumptions that scientific data can be … Continuer la lecture de « Uses and Reuses of Scientific Data: The Data Creators’ Advantage »
Source > hdsr.mitpress.mit.edu, Irene V. Pasquetto, Christine L. Borgman, Morgan F. Wofford, 15 novembre 2019
Dialogu’IST, un 8e atelier le 3 décembre 2019
« Le groupe de travail Dialogu’IST du réseau Renatis vous donne rendez-vous 3 décembre de 13h à 17h pour un nouvel … Continuer la lecture de « Dialogu’IST, un 8e atelier le 3 décembre 2019 »
Source > renatis.cnrs.fr, novembre 2019
Alan Turing Institute – The Turing way
« The Turing Way is a lightly opinionated guide to reproducible data science. Our goal is to provide all the information … Continuer la lecture de « Alan Turing Institute – The Turing way »
Source > the-turing-way.netlify.com, 2019
Reproducible Research through Containerisation: Docker and Singularity
« A container image is a lightweight, standalone, executable package of software that includes everything needed to run an application: code, … Continuer la lecture de « Reproducible Research through Containerisation: Docker and Singularity »
Source > github.com, Eurotech Summer School, EPFL, Lausanne, Switzerland, Rachael Ainsworth, 5 septembre 2019
Repenser la robustesse et la fiabilité en recherche : les chercheurs face à la crise de la reproductibilité
« Les auteurs du compte rendu se focalisent sur les solutions proposées par les intervenants de la journée d’étude du 29 … Continuer la lecture de « Repenser la robustesse et la fiabilité en recherche : les chercheurs face à la crise de la reproductibilité »
Source > ouvrirlascience.fr, aout 2019
Lancement du premier laboratoire public au monde de certification de la reproductibilité de la recherche scientifique
« HEC Paris, l’Université d’Orléans et le CNRS lancent CASCaD, Certification Agency for Scientific Code and Data, le seul laboratoire public … Continuer la lecture de « Lancement du premier laboratoire public au monde de certification de la reproductibilité de la recherche scientifique »
Source > cnrs.fr, 22 juillet 2019
Le book sprint challenge : 3 jours, 5 auteurs pour rédiger un manuel en français sur la reproductibilité de la recherche
« (…) Cet ouvrage considère un ensemble de situations et de pratiques potentiellement dangereuses afin d’illustrer et de mettre en évidence … Continuer la lecture de « Le book sprint challenge : 3 jours, 5 auteurs pour rédiger un manuel en français sur la reproductibilité de la recherche »
Making research results reproducible
« Starting in April of this year, the German Research Foundation (DFG) is supporting a joint project of the Institute for … Continuer la lecture de « Making research results reproducible »
Source > uni-muenster.de, 1 avril 2019
Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente [MOOC]
« (…) Ce MOOC est pour vous, doctorant-e-s, chercheur-se-s , étudiant-e-s en master, enseignant-e-s, ingénieur-e-s de toutes disciplines qui souhaitez vous … Continuer la lecture de « Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente [MOOC] »
Source > fun-mooc.fr, Christophe Pouzat, Arnaud Legrand, Konrad Hinsen, 2019
Introducing eLife’s first computationally reproducible article
« In September 2017 eLife announced the start of the Reproducible Document Stack (RDS) project, a collaboration between Substance, Stencila and … Continuer la lecture de « Introducing eLife’s first computationally reproducible article »
Source > elifesciences.org, Giuliano Maciocci, Michael Aufreiter, Nokome Bentley, 20 février 2019
Open science, reproducibility, and transparency in ecology
« Reproducibility is a key tenet of the scientific process that dictates the reliability and generality of results and methods. The … Continuer la lecture de « Open science, reproducibility, and transparency in ecology »
Source > esajournals.onlinelibrary.wiley.com, Stephen M. Powers, Stephanie E. Hampton, 2018
Evaluating the replicability of social science experiments in Nature and Science between 2010 and 2015
« Being able to replicate scientific findings is crucial for scientific progress. We replicate 21 systematically selected experimental studies in the … Continuer la lecture de « Evaluating the replicability of social science experiments in Nature and Science between 2010 and 2015 »
The Landscape of Open Data Policies
« Transparency is essential for scientific progress. Access to underlying data and materials allows us to make progress through new discoveries … Continuer la lecture de « The Landscape of Open Data Policies »
Source > cos.io, David Mellor, 29 août 2018
Towards a culture of open science and data sharing in health and medical research
« This thesis investigated the factors that contribute to the cultural shift towards open science and data sharing in health and … Continuer la lecture de « Towards a culture of open science and data sharing in health and medical research »
Source > eprints.qut.edu.au, Anisa Rowhani-Farid, 21 août 2018
Open science, research indicators and reproducibility
« There’s been a flurry of reports and announcements on open science over the last few weeks. (…) At July’s Coalition … Continuer la lecture de « Open science, research indicators and reproducibility »
Source > wonkhe.com, Neil Jacobs, 8 août 2018
Émission La Méthode scientifique, Michèle Leduc (COMETS)
« Publications : pourquoi les chercheurs ont-ils tant de mal à se reproduire ? Depuis quand la reproductibilité est elle un critère fondamental … Continuer la lecture de « Émission La Méthode scientifique, Michèle Leduc (COMETS) »
Source > cnrs.fr/comets, 20 septembre 2017
Repères RSTI – Sondage auprès de 1 576 scientifiques sur la reproductibilité des résultats de recherche
« Selon un sondage mené par le Journal Nature auprès de 1 576 scientifiques, plus de 70 % des chercheurs ont échoué … Continuer la lecture de « Repères RSTI – Sondage auprès de 1 576 scientifiques sur la reproductibilité des résultats de recherche »
Source > economie.gouv.qc.ca, 6 juin 2016